Fungicidi se klasificiraju prema svojstvima vodljivosti

1. Sistemični fungicidi
Sistemične fungicide može apsorbirati lišće, stabljika, korijenje i sjeme biljaka u biljke, te se mogu transportirati, raspršiti, zadržati ili proizvoditi metabolite kroz tjelesne tekućine biljaka, što može spriječiti i kontrolirati neke bolesti koje prodiru duboko u biljke ili u endosperm sjemena za zaštitu usjeva Ne inficira se uzročnicima bolesti niti tretira zaražene biljke pa ima terapeutsko i zaštitno djelovanje. Kao što su karbendazim, Lectra, Lvheng br. 2, Duomycin, Shuangyeqing, Thiacin bakar, metalaksil, fosfonaluminij, tiofanat-metil, metokson, fenxining, bakreni metalaks, antivirusna stipsa, dvostruko tretiranje sjemena i tako dalje.
2. Nesistemični fungicidi
Nesistemični fungicidi odnose se na agense koje biljke ne mogu sustavno apsorbirati, provesti i zadržati. Većina sorti su nesistemični fungicidi, koji manje izazivaju razvoj rezistencije patogena i relativno su ekonomični, ali većina njih ima samo zaštitni učinak i ne može spriječiti i kontrolirati bolesti koje prodiru duboko u biljku. Kao što su cink sulfat, bakar sulfat, dodin, klorotalonil, bakar iz zelenog mlijeka, surfaktant, sinergist, spoj sumpora, biljni pepeo, bordoška mješavina, mankozeb, tiram itd. Osim toga, fungicidi se također mogu klasificirati prema načinu uporabe, kao što su sredstva za tretiranje sjemena, sredstva za dezinfekciju tla, sprejevi itd.
3. Zaštitni fungicidi
Uglavnom postoje sljedeće kategorije: sumpor i anorganski sumporni spojevi, kao što je sredstvo za suspendiranje sumpora, čvrsta vapnena sumporna smjesa itd.; pripravci bakra, uglavnom uključujući Bordeaux smjesu, smjesu kuproamonijaka itd.; organski spojevi sumpora, kao što su tiram, cink i cink amonij, mankozeb, itd.; ftalimidi, kao što je kaptan, kaptafol i folpet, itd.; antibiotici, kao što je Jinggangmycin, blasticidin, polioksin, itd.; druge vrste, kao što su Yekuling, Yekujing, Chlorothalonil, Hesuining itd.